5'-O-Trt-N4-Ac-rC ใช้หลักในการสังเคราะห์โอลิโกนิวคลีโอไทด์ โดยทำหน้าที่เป็นบล็อกตัวสร้างนิวคลีโอไซด์ที่ได้รับการป้องกัน กลุ่มไตรติลป้องกันส่วนไฮดรอกซิล 5' ในขณะที่กลุ่มอะซิติลป้องกันอะมีนเอ็กโซไซคลิก เพื่อให้เกิดปฏิกิริยาที่เลือกเฉพาะระหว่างการประกอบโซ่นิวคลีโอไทด์ สารนี้มีความสำคัญในการผลิตลำดับ RNA และ DNA ที่ได้รับการปรับแต่งสำหรับการวิจัย การวินิจฉัย และการประยุกต์ใช้ด้านการบำบัด เช่น โอลิโกนิวคลีโอไทด์แบบแอนติเซนส์และ siRNA กลุ่มป้องกันจะถูกกำจัดออกหลังการสังเคราะห์เพื่อให้ได้กรดนิวคลีอิกที่ใช้งานได้ตามต้องการ