3'-Azido-3'-deoxy-5'-O-tritylthymidine ถูกใช้อย่างแพร่หลายในกระบวนการสังเคราะห์สารเคมีและชีวเคมี โดยเฉพาะในการผลิตสารตั้งต้นสำหรับการสังเคราะห์นิวคลีโอไซด์และนิวคลีโอไทด์ที่มีความสำคัญทางเภสัชกรรม ตัวอย่างเช่น มันถูกนำมาใช้ในการสร้างสารประกอบที่เกี่ยวข้องกับยาต้านไวรัส โดยเฉพาะยาที่ใช้ในการรักษาโรค HIV/AIDS นอกจากนี้ ยังใช้ในการวิจัยทางวิทยาศาสตร์เพื่อศึกษากลไกการทำงานของเอนไซม์และกระบวนการทางชีวเคมีที่เกี่ยวข้องกับการจำลองดีเอ็นเอและอาร์เอ็นเอ โครงสร้างทางเคมีของมันช่วยให้สามารถปรับเปลี่ยนและพัฒนาสารใหม่ๆ ที่มีศักยภาพในการรักษาโรคได้อย่างมีประสิทธิภาพ