5-TFA-aa-2'-deoxycytidine เป็นสารเคมีที่ใช้ในการวิจัยทางชีวเคมีและเภสัชวิทยา โดยเฉพาะในการศึกษาการสังเคราะห์และการปรับเปลี่ยนดีเอ็นเอ มันมักถูกนำมาใช้เป็นสารตั้งต้นหรือตัวกลางในการสังเคราะห์นิวคลีโอไซด์ที่ถูกดัดแปลง ซึ่งมีความสำคัญในการพัฒนายาและสารชีวโมเลกุลใหม่ ๆ นอกจากนี้ ยังมีการนำไปใช้ในกระบวนการสร้าง oligonucleotides ที่ถูกปรับเปลี่ยนเพื่อการวิจัยทางพันธุกรรมและชีววิทยาโมเลกุล รวมถึงการศึกษาการทำงานของเอนไซม์และกลไกทางชีวเคมีที่เกี่ยวข้องกับดีเอ็นเอ