สารเคมีนี้ถูกนำมาใช้หลักในการสังเคราะห์โอลิโกนิวคลีโอไทด์ โดยเฉพาะในสาขาการวิจัยทางพันธุกรรมและชีววิทยาระดับโมเลกุล มันทำหน้าที่เป็นสารเคมีหลักในวิธีฟอสฟอรัมไดไทด์ ซึ่งเป็นวิธีมาตรฐานสำหรับการสร้างลำดับ DNA และ RNA บทบาทของมันคือช่วยอำนวยความสะดวกในการเพิ่มบล็อกนิวคลีโอไทด์ระหว่างการสังเคราะห์โอลิโกนิวคลีโอไทด์แบบอัตโนมัติบนเฟสของแข็ง โครงสร้างของสารประกอบนี้ซึ่งมีกลุ่มโพรพาร์จิลและลิงเกอร์โพลีเอทิลีนไกลคอล (PEG) ช่วยเพิ่มความละลายและปฏิกิริยา ทำให้เหมาะสมสำหรับปฏิกิริยาการจับคู่ที่มีประสิทธิภาพ นอกจากนี้ กลุ่มไดอิโซโพรพิลฟอสฟอรัมไดไทด์ยังช่วยให้ความเสถียรระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ ในขณะที่กลุ่มไซยาโนเอทิลให้การป้องกันต่อปฏิกิริยาไม่พึงประสงค์ สารเคมีนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการผลิตโอลิโกนิวคลีโอไทด์ที่ถูกดัดแปลงสำหรับการประยุกต์ใช้ เช่น การแก้ไขยีน การวินิจฉัย และการพัฒนายา