สารนี้ถูกใช้อย่างแพร่หลายในกระบวนการสังเคราะห์ oligonucleotide ซึ่งเป็นขั้นตอนสำคัญในการผลิต RNA สังเคราะห์ โดยเฉพาะในด้านเคมีกรดนิวคลีอิก ในขั้นตอนการสังเคราะห์ oligonucleotide สารนี้ทำหน้าที่เป็นหน่วยสร้าง (building block) ที่ช่วยในการเชื่อมต่อนิวคลีโอไทด์เข้าด้วยกัน โดยเฉพาะในเทคนิค solid-phase synthesis ซึ่งใช้ในการสร้างสาย RNA oligonucleotide ที่มีความยาวและลำดับที่กำหนดได้อย่างแม่นยำ

นอกจากนี้ สารนี้ยังถูกใช้ในงานวิจัยทางด้านชีววิทยาโมเลกุลและการแพทย์ เช่น การพัฒนายาและวัคซีนที่ใช้ oligonucleotide เป็นส่วนประกอบ การศึกษาการทำงานของยีน และการสร้าง probes สำหรับการวินิจฉัยโรค

เนื่องจากสารนี้มีกลุ่มป้องกัน (protecting groups) เช่น DMT (dimethyltrityl) และ TBDMS (tert-butyldimethylsilyl) ที่ช่วยป้องกันไม่ให้เกิดปฏิกิริยาที่ไม่ต้องการในระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ โดยเฉพาะที่ตำแหน่ง 2'-O เพื่อป้องกันปฏิกิริยาข้างเคียงใน RNA จึงทำให้สามารถควบคุมและเพิ่มประสิทธิภาพในการผลิต RNA oligonucleotide ได้อย่างมีประสิทธิภาพ ส่วนของ phosphoramidite ช่วยให้การเชื่อมต่อกับนิวคลีโอไซด์อื่นๆ มีประสิทธิภาพสูง สนับสนุนการสร้างลำดับ RNA ที่กำหนดเอง