สารนี้มักใช้ในการสังเคราะห์ oligonucleotides ซึ่งเป็นกระบวนการสำคัญในเทคโนโลยีชีวภาพและพันธุวิศวกรรม โดยทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกัน (protecting group) เทอร์ต-บิวทิลไดเมทิลซิลิล (TBDMS) สำหรับหมู่ไฮดรอกซิลที่ตำแหน่ง 5' ของนิวคลีโอไซด์ ซึ่งช่วยป้องกันปฏิกิริยาที่ไม่ต้องการในระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ นอกจากนี้ยังใช้ในขั้นตอนการสร้าง DNA หรือ RNA ที่มีความจำเพาะสูง เพื่อใช้ในการวิจัยทางวิทยาศาสตร์ เช่น การศึกษากลไกของยีน การพัฒนายา และการวินิจฉัยโรค