N6-Benzoyl-2'-deoxyadenosine hydrate ใช้หลักในการวิจัยทางชีวเคมี โดยทำหน้าที่เป็นนิวคลีโอไซด์ที่ดัดแปลงสำหรับศึกษาการมีปฏิสัมพันธ์ของ DNA และกลไกของเอนไซม์ มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์โอลิโกนิวคลีโอไทด์ ซึ่งช่วยในการสำรวจโครงสร้างและหน้าที่ของกรดนิวคลีอิก นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนายาต้านไวรัสและยาต้านมะเร็ง โดยการรวมเข้าใน DNA สามารถช่วยยับยั้งเอนไซม์เฉพาะหรือขัดขวางการจำลองตัวของไวรัส กลุ่มเบนโซอิลของมันช่วยเพิ่มความเสถียร ทำให้มีประโยชน์ในงานทดลองต่างๆ ที่ต้องการนิวคลีโอไซด์ที่ดัดแปลง