3'-O-Acetyl-2'-deoxycytidine ถูกนำมาใช้ในการวิจัยทางชีวเคมีและเภสัชวิทยา โดยเฉพาะในการศึกษาเกี่ยวกับการสังเคราะห์และกระบวนการเมแทบอลิซึมของนิวคลีโอไซด์ นอกจากนี้ยังมีบทบาทสำคัญในการพัฒนายาต้านไวรัสและยาต้านมะเร็ง เนื่องจากโครงสร้างที่สามารถปรับเปลี่ยนได้ทำให้มันเป็นสารตั้งต้นที่มีศักยภาพในการสร้างสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพใหม่ ๆ นอกจากนี้ยังใช้ในการศึกษาการทำงานของเอนไซม์ที่เกี่ยวข้องกับการสังเคราะห์ DNA และ RNA อีกด้วย