N4-Acetyl-3'-O-tert-butyldimethylsilyl-5'-O-DMT-cytidine ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในกระบวนการสังเคราะห์ oligonucleotide โดยเฉพาะในขั้นตอนการสร้างสาย DNA หรือ RNA เทียม ตัวสารนี้ทำหน้าที่เป็นหน่วยโครงสร้างสำคัญ (building block) ในกระบวนการสังเคราะห์ทางเคมีแบบ solid-phase ซึ่งช่วยในการป้องกันกลุ่มฟังก์ชันที่ไม่ต้องการทำปฏิกิริยาในระหว่างขั้นตอนการสังเคราะห์ กลุ่ม DMT (dimethoxytrityl) ช่วยในการควบคุมทิศทางการสังเคราะห์และตรวจสอบประสิทธิภาพของปฏิกิริยา ในขณะที่กลุ่ม tert-butyldimethylsilyl (TBDMS) ทำหน้าที่ป้องกันหมู่ไฮดรอกซิลที่ตำแหน่ง 3' เพื่อให้สามารถทำปฏิกิริยาเฉพาะที่ตำแหน่งที่ต้องการได้ กลุ่มอะซิติลที่ตำแหน่ง N4 ของ cytidine ช่วยป้องกันปฏิกิริยาไม่พึงประสงค์ในระหว่างกระบวนการ หลังจากเสร็จสิ้นกระบวนการสังเคราะห์ กลุ่มป้องกันเหล่านี้สามารถถูกกำจัดออกได้อย่างง่ายดาย เพื่อให้ได้ oligonucleotide ที่มีความถูกต้องและมีประสิทธิภาพสูง ตัวสารนี้มีความสำคัญในการผลิต oligonucleotide ความบริสุทธิ์สูงสำหรับการประยุกต์ใช้ เช่น การสังเคราะห์ยีน, PCR primers, และ antisense therapeutics การใช้งานของมันมีความสำคัญยิ่งในงานวิจัยและพัฒนาการวิศวกรรมพันธุกรรม, การวินิจฉัยทางโมเลกุล, และ oligonucleotide สำหรับการบำบัด