N-Benzoyladenosine ถูกใช้หลักๆ ในงานวิจัยทางชีวเคมีในฐานะนิวคลีโอไซด์ที่ถูกดัดแปลง มันมีบทบาทสำคัญในการศึกษากโครงสร้างและหน้าที่ของ RNA โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการทำความเข้าใจปฏิกิริยาระหว่าง RNA และโปรตีน สารประกอบนี้ยังถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์โอลิโกนิวคลีโอไทด์ที่ถูกดัดแปลง ซึ่งจำเป็นสำหรับการตรวจสอบปฏิกิริยาของกรดนิวคลีอิกและการพัฒนายาตัวช่วยบำบัด นอกจากนี้ N-Benzoyladenosine ยังทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นในการเตรียมนิวคลีโอไซด์อะนาล็อกต่างๆ ซึ่งถูกศึกษาสำหรับคุณสมบัติต้านไวรัสและต้านมะเร็งที่เป็นไปได้ การประยุกต์ใช้ของมันขยายไปยังสาขาเอนไซมวิทยา ที่ซึ่งมันถูกใช้ในการสำรวจกลไกของเอนไซม์ที่เกี่ยวข้องกับการเมแทบอลิซึมของกรดนิวคลีอิก