6-Thioinosine Phosphate ถูกนำมาใช้หลักๆ ในงานวิจัยทางชีวเคมี โดยเฉพาะการศึกษาที่เกี่ยวข้องกับการเผาผลาญนิวคลีโอไทด์และจลนศาสตร์ของเอนไซม์ มันทำหน้าที่เป็นอนุภาคนาฬิกาแทนที่ในงานทดสอบเอนไซม์เพื่อตรวจสอบกลไกของเอนไซม์ เช่น ไนคลีโอไซด์ฟอสฟอริเลสและไคเนส สารประกอบนี้ยังถูกใช้ในการศึกษากลไกการกู้คืนพิวรีน ซึ่งช่วยให้นักวิจัยเข้าใจว่าช่องทางเซลล์รีไซเคิลเบสพิวรีนอย่างไร นอกจากนี้ยังมีศักยภาพในการพัฒนายาต้านไวรัสและยาต้านมะเร็ง เนื่องจากสามารถรบกวนการสังเคราะห์นิวคลีโอไทด์ในเซลล์ที่แบ่งตัวอย่างรวดเร็ว บทบาทในการปรับเปลี่ยนกระบวนการของเซลล์ทำให้เป็นเครื่องมือที่มีค่าทั้งในงานวิจัยพื้นฐานและประยุกต์ทางชีวการแพทย์