โซเดียมเกลือของกัวโนซีน 5'-ไดฟอสเฟต ใช้อย่างแพร่หลายในการวิจัยทางชีวเคมีและการพัฒนายา เป็นสารตั้งต้นที่สำคัญในการศึกษากิจกรรมของเอนไซม์ โดยเฉพาะคินาสและเอนไซม์ที่ขึ้นกับนิวคลีโอไทด์อื่นๆ ในงานวิจัยการส่งสัญญาณเซลล์ มีบทบาทในการศึกษารับเซพเตอร์ที่จับคู่กับโปรตีนจีและเส้นทางการกระตุ้นของ它们 นอกจากนี้ ยังใช้ในการสังเคราะห์ RNA และ DNA เพื่อช่วยให้เข้าใจการเผาผลาญกรดนิวคลีอิก การประยุกต์ใช้ขยายไปถึงการค้นพบยา ซึ่งช่วยในการระบุเป้าหมายบำบัดที่เป็นไปได้ที่เกี่ยวข้องกับการเผาผลาญนิวคลีโอไทด์และกระบวนการส่งสัญญาณเซลล์