มาลโตอ็อกโตสใช้หลักๆ ในงานวิจัยและพัฒนาในสาขาไบโอเคมีและวิทยาศาสตร์อาหาร เป็นสารตั้งต้นสำหรับศึกษากิเนติกส์ของเอนไซม์ โดยเฉพาะอะไมเลสและเอนไซม์ที่ทำงานกับคาร์โบไฮเดรตอื่นๆ เพื่อช่วยให้เข้าใจกลไกและประสิทธิภาพของเอนไซม์เหล่านั้น ในอุตสาหกรรมอาหาร มาลโตอ็อกโตสถูกสำรวจสำหรับศักยภาพในฐานะคาร์โบไฮเดรตที่ปล่อยพลังงานช้าๆ เพื่อให้พลังงานอย่างต่อเนื่องในโภชนาการสำหรับนักกีฬาหรืออาหารฟังก์ชันนัล นอกจากนี้ ยังใช้ในการผลิตสารให้ความหวานพิเศษ และเป็นสาร стабилизаторหรือตัวปรับเนื้อสัมผัสในอาหารแปรรูป การประยุกต์ใช้ยังขยายไปยังภาคเภสัชกรรม ที่ซึ่งมาลโตอ็อกโตสถูกศึกษาสำหรับระบบส่งยาเนื่องจากคุณสมบัติ biocompatibility และการย่อยสลายที่ควบคุมได้