มิโตกวาโซนถูกใช้ในการรักษามะเร็งบางชนิด เช่น มะเร็งต่อมน้ำเหลืองและมะเร็งเม็ดเลือดขาว โดยออกฤทธิ์ยับยั้งการเจริญเติบโตของเซลล์มะเร็งผ่านการรบกวนกระบวนการสังเคราะห์ DNA และ RNA นอกจากนี้ยังมีการศึกษาถึงการใช้ในโรคติดเชื้อไวรัสบางชนิด เช่น HIV เนื่องจากมีคุณสมบัติในการยับยั้งการแพร่พันธุ์ของไวรัส อย่างไรก็ตาม การใช้ต้องอยู่ภายใต้การดูแลของแพทย์เนื่องจากอาจมีผลข้างเคียงที่รุนแรงได้