BC11-38 ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตโมเลกุลที่ซับซ้อน โครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์ของมันช่วยให้สามารถเป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการสร้างยา โดยเฉพาะยาที่มุ่งเป้าไปยังเส้นทางชีวภาพเฉพาะ เช่น สารต้านมะเร็งและยารักษาโรคระบบประสาท นอกจากนี้ BC11-38 ยังถูกนำไปใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับการสังเคราะห์โพลิเมอร์ขั้นสูงและสารเคลือบผิว เพื่อเพิ่มคุณสมบัติเช่น ความทนทานและความต้านทานต่อปัจจัยสิ่งแวดล้อม การประยุกต์ใช้ในงานวิจัยและพัฒนายังครอบคลุมถึงการศึกษาการตอบสนองทางเคมีและกลไก เพื่อให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับเส้นทางสังเคราะห์ใหม่และวิธีการ รวมถึงการศึกษาทางเภสัชวิทยาและชีววิทยาระดับโมเลกุลที่เกี่ยวข้องกับการทำงานของโปรตีนและเอนไซม์