ใช้เป็นสารป้องกัน (protecting group) ในการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะสำหรับอะมีน หมู่ tert-butyl carbamate (Boc) ช่วยรักษาความเสถียรของอะมีนในระหว่างปฏิกิริยาที่ไวต่อ nucleophilicity หรือ basicity ของไนโตรเจน ส่วนย่อย 2,4-dimethoxybenzyl ช่วยเพิ่มความสามารถในการละลายในตัวทำละลายอินทรีย์ และช่วยให้สามารถกำจัดสารป้องกันได้แบบเลือกสรรภายใต้สภาวะออกซิเดชันหรือกรดอ่อนๆ ใช้กันอย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์และสารกลางทางเภสัชกรรมที่ต้องการการสร้างโครงสร้างแบบขั้นตอนและความเข้ากันได้ของหมู่ฟังก์ชัน การใช้สารนี้ช่วยให้ได้ผลผลิตสูงและความบริสุทธิ์โดยลดปฏิกิริยาไม่พึงประสงค์ที่เกี่ยวข้องกับหมู่อะมีน