ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในกระบวนการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในเส้นทางการสร้างสารที่มีโครงสร้างเป็นไซโคลเพนทิล ซึ่งมักพบในสารชีวภาพและยาบางชนิด หมู่ไซลานที่มีอยู่ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกัน (protecting group) สำหรับหมู่แอลกอฮอล์ ช่วยป้องกันไม่ให้เกิดปฏิกิริยาที่ไม่ต้องการในขั้นตอนการสังเคราะห์ และสามารถถอดออกได้ภายหลังในสภาวะที่ควบคุมได้ เหมาะสำหรับการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนในห้องปฏิบัติการ เช่น ในการพัฒนายาหรือสารตั้งต้นของผลิตภัณฑ์ทางเภสัชกรรม