เมทิลฟอสเฟตถูกใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ต่างๆ โดยเฉพาะในการผลิตสารเคมีเกษตร เช่น ยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืช มันทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสร้างสารประกอบที่ควบคุมศัตรูพืชและวัชพืชในพื้นที่เกษตร นอกจากนี้ยังถูกนำมาใช้ในการผลิตสารกันไฟ ซึ่งช่วยเพิ่มคุณสมบัติทนไฟให้กับวัสดุ เช่น ผ้า พลาสติก และสารเคลือบ ในด้านชีวเคมี อนุพันธ์ของเมทิลฟอสเฟตถูกใช้ในการวิจัยเพื่อศึกษาปฏิกิริยาเอนไซม์และเส้นทางเมแทบอลิซึม โดยเฉพาะกระบวนการฟอสโฟรีเลชัน บทบาทของมันในแอปพลิเคชันเหล่านี้เน้นย้ำถึงความสำคัญในทั้งภาคอุตสาหกรรมและวิทยาศาสตร์