Tributyltin chloride ใช้หลักๆ เป็นสารฆ่าเชื้อในสีป้องกันการเกาะติดที่ทาหลักเรือ เรือ และโครงสร้างใต้น้ำ เพื่อป้องกันการเจริญเติบโตของสิ่งมีชีวิตในทะเล เช่น สาหร่าย หอยเชลล์ และสัตว์เปลือกนุ่ม ประสิทธิภาพในการควบคุมการเกาะติดช่วยเพิ่มประสิทธิภาพการใช้เชื้อเพลิงและลดต้นทุนการบำรุงรักษาสำหรับเรือทะเล นอกจากนี้ ยังใช้เป็นสารกันเสียไม้เพื่อป้องกันเชื้อราและแมลง ขยายอายุการใช้งานของไม้ที่ใช้ในงานกลางแจ้ง ในอุตสาหกรรม ใช้เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาเคมี โดยเฉพาะในการผลิตโฟมโพลียูรีเทนและสารเคลือบซิลิโคน อย่างไรก็ตาม เนื่องจากมีความเป็นพิษสูงต่อสิ่งมีชีวิตในน้ำและความคงทนในสิ่งแวดล้อม การใช้จึงถูกควบคุมอย่างเข้มงวดหรือห้ามในหลายภูมิภาค