2,6-Dichloro-1,4-benzoquinone ถูกนำมาใช้ในหลายด้าน โดยเฉพาะในงานวิจัยและอุตสาหกรรมเคมี มักใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารเคมีอื่น ๆ รวมถึงสารประกอบอินทรีย์ที่มีประโยชน์ในอุตสาหกรรม เช่น ยาและสารเคมีเกษตร นอกจากนี้ยังมีการศึกษาในการนำไปใช้เป็นสารออกซิไดซ์ในกระบวนการทางเคมีบางประเภท เนื่องจากมีคุณสมบัติในการรับอิเล็กตรอนได้ดี รวมถึงการวิจัยกลไกการถ่ายโอนอิเล็กตรอน การพัฒนาสีและเม็ดสี และใช้เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาในวิเคราะห์ทางเคมีสำหรับการทดสอบเฉพาะ ในด้านการเกษตร เคมีนี้ถูกทดลองใช้เพื่อควบคุมโรคพืชบางชนิด เนื่องจากมีฤทธิ์ในการยับยั้งการเจริญเติบโตของเชื้อราและแบคทีเรีย นอกจากนี้ยังมีการวิจัยในการนำไปใช้ในกระบวนการบำบัดน้ำเสียเพื่อช่วยลดสารพิษในน้ำได้อีกด้วย