(E)-2-Fluorobenzaldehyde oxime ถูกใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารกลางในการเตรียมเภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตรต่างๆ มันทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการพัฒนาสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ โดยเฉพาะในการสังเคราะห์ตัวยับยั้งและลิแกนด์สำหรับเอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะ อะตอมฟลูออรีนในโครงสร้างช่วยเพิ่มปฏิกิริยาและความสามารถในการจับคู่ ทำให้มีคุณค่าต่อการวิจัยทางเคมียารักษา นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการศึกษาสารประกอบฐานออกซิเม ซึ่งมักถูกสำรวจสำหรับการประยุกต์ใช้เป็นยาแก้พิษสำหรับการวางยาพิษออร์กาโนฟอสเฟต บทบาทในงานวิจัยเคมียังขยายไปถึงการพัฒนาวัสดุใหม่และตัวเร่งปฏิกิริยา

การใช้สารนี้ต้องคำนึงถึงความปลอดภัยและข้อกำหนดทางกฎหมาย เนื่องจากอาจมีผลกระทบต่อสุขภาพและสิ่งแวดล้อม