ใช้เป็นสาร derivatizing ในเคมีวิเคราะห์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในก๊าซโครมาโทกราฟี-สเปกโตรเมตรีมวล (GC-MS) สำหรับการตรวจพบและระบุสารประกอบคาร์บอนิล สารนี้ทำปฏิกิริยาเลือกสรรกับอัลดีไฮด์และคีโตนเพื่อสร้างอนุพันธ์ออกซิมที่เสถียร ซึ่งช่วยเพิ่มความเหินไหลและความเสถียรทางความร้อนเพื่อการแยกโครมาโทกราฟีที่ดีขึ้น กลุ่มเพนตาฟลูออโรฟีนิลให้คุณสมบัติการดักจับอิเล็กตรอนที่แข็งแกร่ง ทำให้เหมาะสมอย่างยิ่งสำหรับการตรวจจับด้วยการดักจับอิเล็กตรอน (ECD) ในการวิเคราะห์ร่องรอย ใช้กันทั่วไปในตัวอย่างสิ่งแวดล้อมและชีวภาพเพื่อตรวจพบคาร์บอนิลในความเข้มข้นต่ำ เช่น สารมลพิษ เมแทโบไลต์ หรือผลิตภัณฑ์การย่อยสลาย