สารไซอะนาซีนเป็นสารกำจัดวัชพืชที่ใช้กันอย่างแพร่หลายในภาคการเกษตร โดยเฉพาะในการปลูกข้าวโพด ฝ้าย และข้าวสาลี สารนี้มีประสิทธิภาพในการควบคุมวัชพืชใบกว้างและวัชพืชประเภทหญ้าที่ขึ้นในระยะเริ่มต้นของพืชเศรษฐกิจ ทำให้ลดการแข่งขันด้านสารอาหาร น้ำ และแสงแดด ช่วยเพิ่มผลผลิตของพืชได้อย่างมีนัยสำคัญ การใช้ไซอะนาซีนมักทำโดยการพ่นลงบนดินหลังจากหว่านเมล็ดพืชแล้ว แต่ก่อนที่วัชพืชจะงอก หรือบางครั้งใช้ร่วมกับสารกำจัดวัชพืชชนิดอื่นเพื่อเพิ่มช่วงการควบคุมวัชพืชให้กว้างขึ้น อย่างไรก็ตาม ต้องระมัดระวังในการใช้เพราะสารนี้อาจสะสมในดินและมีผลกระทบต่อสิ่งแวดล้อม โดยเฉพาะแหล่งน้ำ เนื่องจากมีศักยภาพในการปนเปื้อนน้ำใต้ดิน ในบางประเทศ การใช้ไซอะนาซีนถูกจำกัดหรือห้ามใช้แล้วเนื่องจากข้อกังวลด้านพิษวิทยาและผลกระทบต่อสุขภาพของมนุษย์และสิ่งมีชีวิตอื่น ๆ ดังนั้นการใช้สารนี้จึงต้องปฏิบัติตามแนวทางที่กำหนดอย่างเคร่งครัดเพื่อลดความเสี่ยงที่อาจเกิดขึ้น