ไซอะโซฟามิดใช้เป็นสารกำจัดเชื้อราในเกษตรกรรมเพื่อปกป้องพืชผลจากโรคเชื้อรา โดยเฉพาะอย่างยิ่งต่อ oomycetes ซึ่งก่อให้เกิดโรคใบไหม้และโรคไหม้ดึกในพืช เช่น องุ่น มันฝรั่ง และผักต่างๆ สารนี้ทำงานโดยยับยั้งการหายใจของไมโตคอนเดรียในเชื้อก่อโรค ป้องกันการเจริญเติบโตและการแพร่กระจาย การใช้งานช่วยรักษาสุขภาพพืชและผลผลิต ให้ผลผลิตคุณภาพดี เกษตรกรมักใช้พ่นทางใบ โดยให้ครอบคลุมพื้นผิวพืชอย่างทั่วถึงเพื่อประสิทธิภาพสูงสุด เนื่องจากมีฤทธิ์เฉพาะ จึงเป็นเครื่องมือสำคัญในโปรแกรมการจัดการศัตรูพืชแบบบูรณาการ ลดการใช้สารเคมีแบบกว้าง