บรอมออฟีนอลบลูใช้เป็นตัวบ่งชี้ pH ในงานห้องปฏิบัติการต่างๆ โดยเฉพาะในการทิเทรชันเพื่อหาจุดสิ้นสุดของปฏิกิริยาไทเทรตกรด-เบส โดยเปลี่ยนสีในช่วง pH 3.0 (เหลือง) ถึง 4.6 (น้ำเงิน) ในชีวเคมี ใช้เป็นสีย้อมติดตามในการอิเล็กโทรโฟรีซิสเพื่อติดตามการเคลื่อนที่ของ DNA, RNA หรือโปรตีน นอกจากนี้ ใช้ในจุลชีววิทยาสำหรับย้อมและมองเห็นโคโลนีแบคทีเรีย การเปลี่ยนสีที่สดใสทำให้เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าในการศึกษาเพื่อสอนแนวคิด pH และปฏิกิริยาเคมี