โดบูทามีน เอชซีแอล ใช้หลักๆ ในสถานพยาบาลเป็นยากระตุ้นหัวใจ โดยให้ทางหลอดเลือดดำเพื่อรักษาภาวะหัวใจล้มเหลวเฉียบพลัน ภาวะช็อกจากหัวใจ และการทำงานของหัวใจต่ำหลังผ่าตัดหัวใจ สารนี้ทำงานโดยกระตุ้นตัวรับเบต้า-1 แอดรีเนอร์จิกในหัวใจ เพิ่มความแรงและอัตราการบีบตัวของหัวใจ จึงช่วยปรับปรุงการไหลเวียนเลือดและการส่งออกซิเจนไปยังเนื้อเยื่อ มีประโยชน์เป็นพิเศษในสถานการณ์ที่ต้องการเพิ่มการทำงานของหัวใจอย่างรวดเร็ว เนื่องจากมีระยะเวลาการออกฤทธิ์สั้น จึงมักใช้ในสภาพแวดล้อมที่ควบคุมได้ เช่น หอผู้ป่วยหนัก ที่สามารถตรวจติดตามและปรับขนาดยาอย่างต่อเนื่อง โดบูทามีน เอชซีแอล ยังใช้ในการตรวจเอคโคหัวใจแบบเครียดเพื่อประเมินการทำงานของหัวใจภายใต้สภาวะจำลองการออกกำลังกาย