ใช้เป็นสารกลางในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการเตรียมสารประกอบทางเภสัชกรรม ช่วยในการพัฒนาโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพเนื่องจากมีกลุ่มกวนิดีน ซึ่งมีคุณสมบัติการจับไฮโดรเจนที่แข็งแกร่งและคุณสมบัติเป็นเบส ใช้กันทั่วไปในการสังเคราะห์ยาต้านไวรัส ต้านแบคทีเรีย และต้านเชื้อรา นอกจากนี้ยังใช้ในการผลิตสารเคมีเกษตรและวัสดุฟังก์ชันนัลที่โครงสร้างอุดมด้วยไนโตรเจนช่วยเพิ่มปฏิกิริยาหรือความเสถียร โมเลกุลไซโคลโพรพิลของมันสามารถปรับปรุงความเสถียรทางเมแทบอลิซึมในการออกแบบยา ทำให้มีคุณค่าในการวิจัยเคมียา