3-(เมทิลไทโอ)ฟีนอลถูกใช้หลักในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ต่างๆ โดยเฉพาะในการผลิตสารเคมีเกษตรและเภสัชภัณฑ์ ทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืช ซึ่งโครงสร้างทางเคมีช่วยเพิ่มประสิทธิภาพของผลิตภัณฑ์เหล่านี้ นอกจากนี้ยังนำมาใช้ในการพัฒนายาเภสัชบางชนิด โดยเฉพาะตัวยาที่เล็งเป้าไปยังเส้นทางชีวเคมีเฉพาะ ในอุตสาหกรรมน้ำหอม 3-(เมทิลไทโอ)ฟีนอลถูกนำมาใช้เป็นสารตั้งต้นในการสร้างสารอะโรมาติกซับซ้อน เพิ่มโน้ตกลิ่นเฉพาะตัว (คล้ายกระเทียมและหัวหอม) ให้กับน้ำหอม สารปรุงแต่งกลิ่นรส และเครื่องสำอาง ความยืดหยุ่นในการเกิดปฏิกิริยาทางเคมีทำให้มีคุณค่าต่อการวิจัยและการประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนาวัสดุใหม่และสารเคมีพิเศษ