Phenoxyacetyl chloride ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการผลิตเภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตร ใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์อนุพันธ์กรด phenoxyacetic acid ซึ่งจำเป็นสำหรับการพัฒนาสารกำจัดวัชพืชและสารควบคุมการเจริญเติบโตของพืช นอกจากนี้ ยังใช้เป็นรีเอเจนต์ในการเตรียมส่วนประกอบเภสัชกรรมที่ใช้งานได้หลากหลาย (APIs) รวมถึงยาปฏิชีวนะและยาต้านการอักเสบ ความตอบสนองของมันกับอะมีนและแอลกอฮอล์ทำให้มีคุณค่าในการสร้างเอสเทอร์และอะไมด์ ซึ่งเป็นพื้นฐานในการพัฒนายาและการผลิตเคมีภัณฑ์ละเอียด