PCMPA hydrochloride ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการวิจัยทางชีวเคมี โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการศึกษาการยับยั้งเอนไซม์และเส้นทางส่งสัญญาณการเปลี่ยนแปลง (signal transduction pathways) มันทำหน้าที่เป็นตัวยับยั้งที่แรงต่อฟอสฟาทาสเฉพาะเจาะจง ทำให้มีคุณค่าต่อการตรวจสอบกระบวนการเซลล์ เช่น การเจริญเติบโตของเซลล์ การแยกตัว (differentiation) และการตายของเซลล์แบบ apoptosis นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการศึกษาทางเภสัชวิทยาเพื่อสำรวจการประยุกต์ใช้ทางบำบัดที่เป็นไปได้ในโรคที่เกี่ยวข้องกับกิจกรรมฟอสฟาทาสที่ผิดปกติ เช่น มะเร็งและโรคระบบประสาทเสื่อมถอย บทบาทของมันในการปรับเปลี่ยนกิจกรรมเอนไซม์ยังช่วยในการทำความเข้าใจเส้นทางเมแทบอลิซึมและการออกแบบยาที่กำหนดเป้าหมาย