กรดฟอสโฟนิก (4-เมทอกซิเบนซิล) ถูกนำไปใช้หลัก ๆ ในสาขาการสังเคราะห์อินทรีย์และวิทยาศาสตร์วัสดุ โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการเตรียมสารประกอบเบสฟอสโฟเนตต่าง ๆ ซึ่งจำเป็นในการพัฒนาสารยับยั้งการติดไฟ สารยับยั้งการกัดกร่อน และสารยับยั้งการเกิดคราบตะกรันในงานอุตสาหกรรม นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการสังเคราะห์โมเลกุลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ โดยเฉพาะในเคมียารักษาโรค ซึ่งช่วยในการสร้างยารักษาที่มีศักยภาพที่มุ่งเป้าไปยังเอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะ โครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์ของมันยังทำให้เหมาะสำหรับการใช้ในการพัฒนาโครงสร้างโลหะ-อินทรีย์ (MOFs) และวัสดุขั้นสูงอื่น ๆ ที่มีคุณสมบัติในการเร่งปฏิกิริยา การเก็บก๊าซ และเทคโนโลยีการแยก