เบนซ์ไฮดริลฟอสโฟนิกแอซิดถูกนำมาใช้เป็นหลักในการสังเคราะห์สารอินทรีย์ในฐานะส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น โครงสร้างของมันทำให้มีคุณค่าสำคัญในการพัฒนายา โดยเฉพาะในการออกแบบยาที่เล็งเป้าไปยังเอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะ สารประกอบนี้ยังถูกนำมาใช้ในการเตรียมโพลิเมอร์การประสานและโครงสร้างโลหะ-อินทรีย์ (MOFs) ซึ่งกลุ่มฟอสโฟนิกแอซิดของมันช่วยให้เกิดการจับกับไอออนโลหะอย่างแข็งแกร่ง นำไปสู่การพัฒนาวัสดุที่มีศักยภาพในการใช้งานด้านการเร่งปฏิกิริยา การเก็บก๊าซ และกระบวนการแยก นอกจากนี้ มันยังทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์ลิแกนด์ที่ขึ้นอยู่กับฟอสโฟเนต ซึ่งถูกนำมาใช้ในปฏิกิริยาเคมีหลากหลายและกระบวนการอุตสาหกรรม