กรด (Pyridin-3-ylmethyl)phosphonic ถูกนำมาใช้หลักๆ ในสาขาเคมียารักษาโรคในฐานะสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพหลากหลาย โครงสร้างของมันซึ่งรวมวงแหวนไพริดีนกับกลุ่มกรดฟอสโฟนิก ทำให้เป็นส่วนประกอบที่มีคุณค่าสำหรับการออกแบบโมเลกุลที่มีการประยุกต์ใช้ทางรักษา มักถูกใช้ในการพัฒนายับยั้งเอนไซม์ โดยเฉพาะที่เล็งเป้าไปยังไคเนสและฟอสฟาทาส ซึ่งมีบทบาทสำคัญในเส้นทางส่งสัญญาณเซลล์ นอกจากนี้ สารประกอบนี้ยังถูกสำรวจในการสร้างสารจับโลหะ เคลติ้ง ซึ่งมีประโยชน์ในการเร่งปฏิกิริยาและวิทยาศาสตร์วัสดุ ความหลากหลายของมันยังขยายไปสู่การวิจัยสารเคมีเกษตร ที่ซึ่งมันมีส่วนช่วยในการออกแบบยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชใหม่ๆ