BETP ใช้หลักๆ ในสาขาการสังเคราะห์อินทรีย์ในฐานะสาร phosphorylating agent ซึ่งช่วยในการนำกลุ่มฟอสเฟตเข้าสู่โมเลกุล สิ่งนี้มีความสำคัญอย่างยิ่งในการพัฒนายาและสารประกอบชีวภาพที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ บทบาทของมันมีความสำคัญเป็นพิเศษในการสังเคราะห์อนุพันธ์นิวคลีโอไทด์ ซึ่งจำเป็นสำหรับการพัฒนายาต้านไวรัสและยารักษามะเร็ง นอกจากนี้ ยังใช้เป็นสารเคมีในกระบวนการปรับเปลี่ยนเปปไทด์และโปรตีน เพื่อเพิ่มความเสถียรและการทำงานสำหรับการประยุกต์ใช้ทาง درمانی