4-Fluoroisoindoline-1,3-dione ถูกนำมาใช้เป็นสารตั้งต้นหรือสารกลางในการสังเคราะห์สารเคมีที่มีความซับซ้อน โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม ซึ่งอาจนำไปใช้ในการพัฒนายาใหม่ๆ ที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น ยาต้านมะเร็งหรือยาต้านจุลชีพ นอกจากนี้ ยังอาจถูกใช้ในกระบวนการวิจัยและพัฒนาสารเคมีเพื่อศึกษาปฏิกิริยาและกลไกทางเคมีที่เกี่ยวข้องกับโมเลกุลที่มีโครงสร้างเฉพาะ ซึ่งช่วยในการออกแบบและปรับปรุงประสิทธิภาพของสารสังเคราะห์ต่างๆ