อะมิกดาลินถูกใช้หลักๆ ในทางการแพทย์ทางเลือกเพื่อรักษามะเร็ง แม้ว่าประสิทธิภาพและความปลอดภัยจะเป็นที่ถกเถียงกันอย่างมากและไม่ได้รับการสนับสนุนจากหลักฐานทางวิทยาศาสตร์ที่แข็งแกร่ง มักถูกทำตลาดในชื่อ "วิตามินบี 17" และพบในเมล็ดผลไม้เช่นแอปริคอต、พีช และอัลมอนด์ ผู้สนับสนุนอ้างว่าสามารถกำหนดเป้าหมายและทำลายเซลล์มะเร็งได้ แต่การศึกษาทางคลินิกแสดงให้เห็นประโยชน์ต้านมะเร็งที่ไม่มีนัยสำคัญและก่อให้เกิดความกังวลเกี่ยวกับความเป็นพิษที่อาจเกิดขึ้น เมื่อถูกเมแทบอลิซึม อะมิกดาลินสลายตัวเป็นไฮโดรเจนไซยาไนด์ ซึ่งอาจเป็นอันตรายหรือถึงตายในปริมาณสูง เนื่องจากความเสี่ยงเหล่านี้ การใช้ถูกคัดค้านโดยแพทย์กระแสหลัก และถูกห้ามในบางประเทศ