7-Piperazin-1-yl-thieno ถูกนำมาใช้เป็นหลักในสาขาเคมีเภสัชกรรมในฐานะสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพต่างๆ โครงสร้างของมันที่รวมวงแหวน piperazine ทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่มีคุณค่าสำหรับการพัฒนาโมเลกุลที่มีการประยุกต์ใช้ทาง درمانیที่เป็นไปได้ มันมักถูกใช้ในการออกแบบและสังเคราะห์ยาตัวสมัครที่มุ่งเป้าไปที่ความผิดปกติของระบบประสาทส่วนกลาง เช่น ยาต้านโรคจิตหรือยาต้านอาการซึมเศร้า เนื่องจากความสามารถในการโต้ตอบกับตัวรับสารสื่อประสาทเฉพาะ นอกจากนี้ยังทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นในการพัฒนาสารประกอบที่มีคุณสมบัติต้านจุลินทรีย์หรือต้านมะเร็ง โดยใช้กรอบ heterocyclic เพื่อเพิ่มความสัมพันธ์ในการจับและประสิทธิภาพ นักวิจัยยังสำรวจการใช้ในการสร้างลิแกนด์ใหม่สำหรับการศึกษาตัวรับ ช่วยในการทำความเข้าใจเส้นทางชีวเคมีและกระบวนการค้นพบยา