ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในกระบวนการผลิตยาที่มีโครงสร้างพิเพอร์ราซีนเป็นส่วนสำคัญ ทำหน้าที่เป็นตัวกลางในการสร้างพันธะกับกลุ่มฟังก์ชันอื่น ๆ เพื่อพัฒนายาที่มีฤทธิ์เฉพาะทาง เช่น ยาแก้ซึมเศร้า ยาต้านจิตประสาท หรือสารที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง เนื่องจากมีหมู่อัลดีไฮด์และหมู่ไฮดรอกซี จึงสามารถทำปฏิกิริยาต่อได้หลากหลาย ช่วยให้การออกแบบโมเลกุลของยาเป็นไปอย่างยืดหยุ่นและมีประสิทธิภาพ