ไพเพอริดีนไฮโดรคลอไรด์ถูกใช้ในหลายอุตสาหกรรมและงานวิจัย ในการสังเคราะห์สารเคมี มันเป็นสารตั้งต้นสำคัญสำหรับการผลิตยาชนิดต่าง ๆ เช่น ยาต้านไวรัส ยาต้านมะเร็ง และยารักษาโรคทางระบบประสาท นอกจากนี้ยังใช้เป็นรีเอเจนต์ในกระบวนการสังเคราะห์สารอินทรีย์ ช่วยในการสร้างวงแหวนไพเพอริดีนซึ่งเป็นโครงสร้างหลักของสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพหลายชนิด ในทางเภสัชกรรม มันมีบทบาทในการปรับปรุงคุณสมบัติทางกายภาพและเคมีของยาเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพการดูดซึมและความคงตัว นอกจากนี้ยังมีการใช้ในห้องปฏิบัติการเพื่อการศึกษาทางเคมีและชีวเคมีอีกด้วย