ใช้ในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์ในฐานะบล็อกก่อสร้างที่ได้รับการป้องกันสำหรับเปปไทโดมิมิติกส์และสารประกอบเฮเทโรไซคลิก หมู่ Boc ให้การป้องกันอะมีนระหว่างปฏิกิริยาการจับคู่ ในขณะที่หน้าที่ของ thiol อนุญาตให้มีการจับคู่แบบเลือกสรร เช่น ในการก่อตัวของพันธะดิซัลไฟด์หรือพันธะไทโออีเทอร์ ใช้กันทั่วไปในการพัฒนายับยั้งโปรติเอสและยาที่กำหนดเป้าหมายซึ่งต้องการปฏิกิริยาที่ควบคุมได้และความแข็งแรงของโครงสร้าง โครงสร้างพิเพอริดีนของมันสนับสนุนการจำกัดคอนฟอร์เมชันในการออกแบบยา เพิ่มความเลือกสรรและความเสถียรทางเมแทบอลิซึม