ใช้ในงานวิจัยด้านชีววิทยาของพืช โดยเฉพาะในการศึกษาบทบาทของฮอร์โมนพืชที่เกี่ยวข้องกับการเจริญเติบโต การแบ่งเซลล์ และการพัฒนาราก เนื่องจากสารนี้มีโครงสร้างคล้ายกับฮอร์โมนออกซิน (auxin) จึงสามารถใช้เป็นสารกระตุ้นการงอกของรากในพืชบางชนิดได้ นิยมใช้ในห้องปฏิบัติการเพาะเลี้ยงเนื้อเยื่อพืช เพื่อช่วยเพิ่มอัตราการเกิดรากในต้นกล้าที่เพาะเลี้ยงในสภาพปลอดเชื้อ นอกจากนี้ยังใช้เป็นมาตรฐานในการวิเคราะห์ทางโครมาโทกราฟีเมื่อต้องการตรวจสอบสารอนุพันธ์ของอินโดลในพืช