1,2,3,7,8-เฮกซะไฮโดรไพรีนใช้หลักๆ ในเคมีสิ่งแวดล้อมเป็นตัวบ่งชี้สำหรับการปนเปื้อนของสารประกอบโพลีไซคลิกอะโรมาติกไฮโดรคาร์บอน (PAH) ช่วยในการติดตามแหล่งกำเนิดมลพิษและประเมินผลกระทบต่อสิ่งแวดล้อม ในการวิจัย ทำหน้าที่เป็นสารโมเดลสำหรับศึกษาพฤติกรรมของ PAH ในระบบนิเวศต่างๆ นอกจากนี้ ยังใช้ในเคมีวิเคราะห์สำหรับการพัฒนาวิธีการและการสอบเทียบในการตรวจจับ PAH