Polyhexamethyleneguanidine hydrochloride ใช้เป็นสารฆ่าเชื้อที่มีประสิทธิภาพสูงในหลายอุตสาหกรรม เช่น ในอุตสาหกรรมอาหารและเครื่องดื่ม เพื่อป้องกันการเจริญเติบโตของแบคทีเรียและเชื้อรา นอกจากนี้ยังใช้ในอุตสาหกรรมสิ่งทอเพื่อป้องกันการเกิดกลิ่นอับและเชื้อโรคบนผ้า ในภาคเกษตรกรรม สารนี้ใช้เป็นสารป้องกันและกำจัดเชื้อโรคในพืช และยังใช้ในผลิตภัณฑ์ทำความสะอาดบ้านเรือนเพื่อฆ่าเชื้อบนพื้นผิวต่างๆ ด้วยคุณสมบัติในการฆ่าเชื้อที่แข็งแกร่งและความปลอดภัยในการใช้งาน ทำให้เป็นที่นิยมในหลายๆ ด้าน