4-Methylmorpholine hydrochloride ใช้เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาในการสังเคราะห์โฟมโพลียูรีเทน โดยช่วยเสริมปฏิกิริยาระหว่างไอโซไซยาเนตและโพลิออล นอกจากนี้ยังใช้ในการผลิตยา โดยเฉพาะอย่างยิ่งเป็นตัวเร่งปฏิกิริยาในการสังเคราะห์ส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) ในเคมีอินทรีย์ ทำหน้าที่เป็นตัวกันชนและเบสอ่อนในปฏิกิริยาต่างๆ นอกจากนี้ยังนำไปใช้ในการผลิตสารเคมีเกษตร ช่วยในการพัฒนายาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืช ในอุตสาหกรรมสิ่งทอ มีบทบาทเป็นสารช่วยย้อมสี ช่วยเพิ่มประสิทธิภาพในการยึดติดของสีย้อมบนผ้า