Coproporphyrin III ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการวินิจฉัยทางการแพทย์ในฐานะตัวบ่งชี้ทางชีวภาพสำหรับความผิดปกติต่างๆ ที่เกี่ยวข้องกับการสังเคราะห์ฮีม โดยเฉพาะอย่างยิ่งโรคพอร์ไฟเรีย เช่น พอร์ไฟเรียเฉียบพลันแบบสลับ (acute intermittent porphyria) และพอร์ไฟเรียโคโพรพันธุกรรม (hereditary coproporphyria) มันช่วยในการระบุและติดตามสภาวะเหล่านี้ ในการวิจัย มันทำหน้าที่เป็นสารประกอบหลักในการศึกษาการเมแทบอลิซึมของฮีมและเส้นทางเอนไซม์ นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในงานทดสอบชีวเคมีเพื่อทำความเข้าใจความเครียดออกซิเดชันและการทำงานของไมโตคอนเดรีย บทบาทของมันในด้านเหล่านี้ทำให้เป็นเครื่องมือที่มีค่าทั้งในสถานพยาบาลและห้องปฏิบัติการ รวมถึงการประเมินภาวะสุขภาพและการทำงานของตับ