Cathepsin L-IN-2 ถูกนำมาใช้ในการวิจัยทางการแพทย์เพื่อศึกษาบทบาทของเอนไซม์ Cathepsin L ในการเกิดโรคต่างๆ เช่น มะเร็ง โรคติดเชื้อ และโรคทางระบบประสาท โดยสารนี้มีศักยภาพในการยับยั้งกิจกรรมของ Cathepsin L ซึ่งอาจช่วยลดการแพร่กระจายของเซลล์มะเร็งและชะลอการพัฒนาของโรค นอกจากนี้ยังมีการศึกษาเพื่อประยุกต์ใช้ในการพัฒนายาต้านไวรัส เนื่องจาก Cathepsin L มีส่วนเกี่ยวข้องในกระบวนการติดเชื้อของไวรัสบางชนิด เช่น SARS-CoV-2 การวิจัยในอนาคตอาจนำไปสู่การพัฒนายาใหม่ๆ ที่มีประสิทธิภาพสูงในการรักษาโรคที่เกี่ยวข้องกับเอนไซม์นี้