Carboxypeptidase G จาก Pseudomonas sp. ใช้หลักในการแพทย์และเทคโนโลยีชีวภาพ มีบทบาทสำคัญในการบำบัดมะเร็ง โดยเฉพาะการรักษาความเป็นพิษจากเมโธเทร็กเซท (methotrexate) ซึ่งเป็นยาเคมีบำบัดที่อาจสะสมถึงระดับพิษในผู้ป่วยที่มีการทำงานของไตบกพร่อง เอนไซม์นี้ตัดเมโธเทร็กเซทให้เป็นเมตาโบไลต์ที่ไม่เป็นพิษ ช่วยในการขจัดออกจากร่างกายอย่างรวดเร็ว นอกจากนี้ ยังใช้ในงานทดสอบเอนไซม์และการวิจัยเพื่อศึกษากโครงสร้างของเปปไทด์และโปรตีน เนื่องจากความจำเพาะในการตัดกรดกลูตาเมตที่ปลาย C-terminal การประยุกต์ใช้ขยายไปสู่การพัฒนาระบบส่งยาแบบกำหนดเป้าหมาย โดยใช้ในการกระตุ้นโปรดรักที่บริเวณเนื้องอกโดยเฉพาะ เพื่อเพิ่มประสิทธิภาพการรักษาและลดผลข้างเคียง