Fmoc-β-HomoThr(tBu)-OH ใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในกระบวนการ solid-phase peptide synthesis (SPPS) ซึ่งเป็นวิธีการที่นิยมในการสร้างเปปไทด์ในห้องปฏิบัติการ กลุ่ม Fmoc (Fluorenylmethyloxycarbonyl) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันชั่วคราวสำหรับหมู่อะมิโน ในขณะที่กลุ่ม tBu (tert-butyl) ปกป้องหมู่ไฮดรอกซิลของกรดอะมิโน การใช้สารนี้ช่วยให้สามารถควบคุมลำดับและโครงสร้างของเปปไทด์ได้อย่างแม่นยำ นอกจากนี้ ยังมีบทบาทสำคัญในการวิจัยและพัฒนายา โดยเฉพาะการออกแบบเปปไทด์ที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพหรือใช้เป็นสารตั้งต้นในการสร้างโมเลกุลที่มีความซับซ้อน