สารประกอบนี้ถูกนำมาใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์และโมเลกุลอินทรีย์อื่นๆ โดยทำหน้าที่เป็นตัวกลางสำคัญในการผลิตสารประกอบเภสัชกรรมที่ซับซ้อน โครงสร้างของมันซึ่งมีกลุ่มป้องกัน tert-butoxycarbonyl (Boc) ทำให้มีคุณค่าอย่างยิ่งในเคมีเปปไทด์ ซึ่งการป้องกันและถอดป้องกันกลุ่มฟังก์ชันอย่างเลือกสรรเป็นสิ่งจำเป็น กลุ่ม Boc สามารถถอดออกได้ง่ายภายใต้สภาวะกรดอ่อนๆ ซึ่งช่วยให้สามารถปรับแต่งโมเลกุลเพิ่มเติมได้ นอกจากนี้ หมู่เอสเตอร์เบนซิลยังให้ความเสถียรในระหว่างกระบวนการสังเคราะห์และสามารถตัดออกได้โดยการไฮโดรเจนเนชันเมื่อจำเป็น สารเคมีนี้มักถูกใช้ในการพัฒนาโมเลกุลที่ biologically active รวมถึงผู้สมัครยาที่มีศักยภาพ เนื่องจากช่วยอำนวยความสะดวกในการแปลงเคมีที่แม่นยำและมีประสิทธิภาพ การประยุกต์ใช้ของมันเด่นชัดเป็นพิเศษในสาขาเคมียารักษา ซึ่งช่วยในการสร้างตัวแทนบำบัดใหม่ๆ