ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์เปปไทด์และโปรตีนในกระบวนการ solid-phase peptide synthesis (SPPS) โดยกลุ่ม Fmoc ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกัน (protecting group) สำหรับหมู่อะมิโน ซึ่งสามารถกำจัดออกได้ง่ายโดยใช้เบส เช่น ไพเปอริดีน นอกจากนี้ หมู่โบรโมในโครงสร้างยังช่วยให้สามารถทำปฏิกิริยาเพิ่มเติมได้ เช่น ปฏิกิริยา cross-coupling ในการปรับแต่งโมเลกุลเพิ่มเติม งานวิจัยด้านเคมีอินทรีย์และชีวเคมีมักใช้สารนี้เพื่อพัฒนาสารประกอบใหม่ที่มีศักยภาพทางเภสัชวิทยา